La segunda reunión del Comité Organizador fue realizada en París en noviembre de 1946. Se avanzó en la Constitución y los Reglamentos y se decidió invitar a la Asociación Médica de Estados Unidos (AMA) a nombrar uno de sus miembros para participar en el Comité Organizador. La AMA nombró al Dr. Louis H. Bauer - primer Secretario General de la AMM - y al Dr. Elmer L. Anderson como sustituto.

El proyecto final de Constitución y Reglamentos fue aprobado en la tercera reunión del Comité Organizador en Londres, en abril de 1947 y se planificó celebrar la Primera Asamblea General en París en septiembre de 1947. El proyecto fijó un pago de 20 céntimos suizos por miembro de la asociación médica nacional con una subscripción mínima de 1.000 francos suizos y un máximo de 10.000.

La cuarta y última reunión del Comité Organizador fue realizada en París en 1947, el dían anterior de la Asamblea General (18 de septiembre de 1947). El proyecto de Constitución y Reglamentos fue adoptado el primer día de la Asamblea con enmiendas menores. La reunión fue la Primera Asamblea General de la AMM y hubo 27 asociaciones médicas nacionales representadas que se convirtieron en las asociaciones fundadoras.

Estas asociaciones fueron las siguientes:
- Federal Council of the BMA in Australia
- Osterreichische Arztekammer (Austria)
- Fédération Médicale Belge
- Canadian Medical Association
- Chinese Medical Association (se retiró en 1952)
- Ustredni Jednota Ceskych Lekaru (dejó de existir en 1948)
- Den Almindelige Danske Laegeforening (Dinamarca)
- Medical Association of Eire (cambió a Irish Medical Association)
- La Confédération des Syndicats Médicaux Français
- British Medical Association
- Association Médicale Panhellenique (Grecia)
- Laeknafelga Islands (Islandia)
- Indian Medical Association
- Palestine Jewish Medical Association (cambió después a Israel Medical Association en 1949)
- Federazione Nazionale degli Ordini dei Medici d'Italia
- Syndicats des Médecins du Grand Duché de Luxembourg
- Koninklijke Nederlandsche Maatschappij tot Bevordering der Geneeskunst (Holanda)
- Den Norske Laegeforening (Noruega)
- Palestine Arab Medical Association (dejó de existir en 1949)
- Naczelna Izby Lekarska (se retiró en 1949)
- Medical Association of South Africa
- Colegio Oficial de Médicos de Espana
- Sveriges Lakarforbund (Suecia)
- Fédération des Médecins Suisses
- Turkish Medical Chamber (reemplazada por Union of Turkish Physicians)
- American Medical Association

El Prof. Eugène Marquis de Francia fue elegido primer Presidente de la AMM, el Dr. Jar. Stucklik, Checoslovaquia, fue elegido Presidente-Electo, el Dr. Otto Leuch, Suiza, fue elegido Tesorero y el Dr. Charles Hill, Gran Bretaña, fue elegido Secretario Honorario temporal. El primer Consejo, compuesto por 10 miembros, fue elegido y la Asociación Médica Mundial fue lanzada oficialmente.

La Constitución, una vez adoptada, proporcionó afiliación a las asociaciones médicas nacionales más representativas de la profesión médica en sus países o territorios, pero sólo una asociación por país. La Asamblea General quedó encargada del control general de las políticas y los asuntos de la asociación y de reunirse anualmente en un país distinto. El organismo ejecutivo, el Consejo, recibió instrucciones de administrar los asuntos de la Asociación y de informar una vez al año a la Asamblea. El Consejo estuvo formado por tres dirigentes elegidos y diez miembros elegidos por la Asamblea.

Se determinó que los idiomas oficiales de la AMM serían inglés, francés y español, además de publicar un boletín o revista como órgano oficial de la AMM.

A fin de facilitar el apoyo financiero de sus asociaciones miembros durante un período en que las transacciones monetarias estaban restringidas por muchos gobiernos, se consideró que Suiza y EE.UU. eran los lugares con más ventajas para establecer el Secretariado de la nueva asociación. En 1948, el Consejo estableció el Secretariado de la AMM en la ciudad de Nueva York a fin de tener una relación estrecha con la ONU y sus distintos organismos. El Dr. Louis H. Bauer fue nombrado Secretario General. El Secretariado estuvo en Nueva York hasta 1974, año en que por razones económicas y para estar más cerca de las organizaciones internacionales de Ginebra (OMS, OIT, ICN, ISSA, etc) fue transferido a su ubicación actual en Ferney-Voltaire, Francia.

En julio de 1964, la AMM fue incorporada al estado de Nueva York como organización educacional y científica sin fines de lucro. Esta incorporación estableció el estado financiero y legal de la AMM en EE.UU., en el que los miembros del Consejo pasarían a ser la Junta Directiva de la Asociación. También hizo posible lograr un reconocimiento libre de impuestos de los fondos donados a la AMM y para los donadores de contribuciones financieras. La incorporación de la AMM fue adoptada en la XIX Asamblea Médica Mundial celebrada en Londres en 1965.

En 1962, la reunión anual de delegados fue cambiada a "Asamblea Médica Mundial" después de una revisión de la Constitución y Reglamentos durante la XV Asamblea General.

Sede de la AMM desde su creación hasta 1974: Nueva York, EE.UU

Desde 1975 hasta la actualidad: FERNEY-VOLTAIRE, FRANCIA